| بررسی کارایی توالی ژن 16S rRNA در روابط تبارشناسی باکتری‌های مولد گال جداسازی شده از درختان گیلاس و آلو در استان آذربایجان غربی |
| کد مقاله : 1033-2IPPC-FULL |
| نویسندگان: |
|
مریم خضری *1، کیوان فری2، مسعود ابرین بنا3، مینا راستگو3 1عضو هیات علمی موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور 2گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه. ارومیه. ایران 3گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه. ارومیه. ایران. |
| چکیده مقاله: |
| بیماری گال طوقه از بیماری‌های مهم و اقتصادی گیاهان در باغ‌ها، مزارع و نهالستان‌ها است. این بیماری توسط یک باکتری خاک-برد با دامنه میزبانی وسیع ایجاد می‌شود که باکتری بدون وجود زخم روی سطح گیاه میزبان، قادر به نفوذ به گیاه و ایجاد بیماری نیست. در این مطالعه، تعداد 113 جدایه باکتری از گال‌های ایجاد شده روی درختان گیلاس و آلو در استان آذربایجان غربی جداسازی شد. بر اساس آزمون اثبات بیماری‌زایی روی گیاهچه‌های گوجه‌فرنگی و ایجاد گال روی طوقه گیاهچه‌ها، تعداد 21 جدایه بیماری‌زا تشخیص داده شد. در مطالعات قبلی، بر اساس نتایج آزمون‌های بیوشیمیایی، فیزیولوژیکی و تکثیر قطعات 224 و 338 جفت‌بازی به ترتیب با استفاده از آغازگرهای اختصاصی VirD2A/VirD2C′ و VirD2A/VirD2E′، این جدایه‌ها به عنوان باکتری Agrobacterium tumefaciens شناسایی شدند. روابط تبارشناسی سویه‌های باکتریایی گال‌زا با استفاده از توالی ژن 16S rRNA مورد ارزیابی قرار گرفت. درخت تبارشناسی شامل توالی 6 سویه A. tumefaciens این مطالعه، 15 سویه A. tumefaciens و سویه‌هایی از گونه‌های نزدیک به این گونه شامل A. vitis، A. albertimagni، A. rhizogenes، A. rubi، Rhizobioum legominasarum، Sinrhizobium chiapanecum و Mesorhizobium tianshanense اخذ شده از GenBank بود. توالی‌های این مطالعه در چهار کلاد اصلی به همراه سویه‌های A. tumefaciens اخذ شده از GenBank گروه‌بندی شدند. نتایج درخت فیلوژنی ترسیم شده نشان داد ژن 16S rRNA کارایی لازم در تفکیک سویه‌های A. tumefaciens، از سویه‌های سایر گونه‌های جنس اگروباکتریوم به‌ویژه گونه A. rubi را ندارد، به‌طوری‌که یک کلاد شامل شش سویه A. rubi در بین دو کلاد از سویه‌های باکتری A. tumefaciens قرار گرفت و این گونه‌ها از هم تفکیک نشدند. با توجه به این نتایج، پیشنهاد می‌شود در بررسی روابط تبارشناسی گونه‌های جنس اگروباکتریوم، از توالی‌های ژن‌های خانه‌داری باکتری استفاده شود تا نتایج دقیق‌تری از موقعیت آرایه‌های این باکتری‌ها به‌دست آید. |
| کلیدواژه ها: |
| گال طوقه، تبارشناسی، گیلاس، آلو، اگروباکتریوم |
| وضعیت : مقاله برای ارائه به صورت پوستر پذیرفته شده است |